国立大学法人神戸大学;NATIONAL UNIVERSITY CORPORATION KOBE UNIVERSITY
发明人:
KATAYAMA, Kenta,片山健太,NISHIDA, Keiji,西田敬二
申请号：
JPJP2020/009553
公开号：
WO2020/184402A1
申请日:
2020.03.06
申请国别(地区):
JP
年份:
2020
代理人:
摘要：
The present invention provides a method for selecting a promoter that functions in organelle, the method including a step (1) for preparing sequence information obtained from RNA sequence analysis； a step (2) for mapping the sequence information prepared in step (1) onto organelle DNA sequence； a step (3) for determining, based on the mapping information obtained in step (2), the amount of change in the RNA expression in individual regions； a step (4) for selecting regions in which the amount of change obtained in the step (3) is within the range of a reference value that is predetermined； and a step (5) for determining a region, from among said selected regions, that is appropriate as a promoter that functions in organelle.La présente invention concerne un procédé destiné à la sélection d'un promoteur qui fonctionne dans un organite, le procédé comprenant une étape (1) destinée à préparer des informations de séquence obtenues à partir d'une analyse de séquence d'ARN ； une étape (2) destinée à mapper les informations de séquence préparées à l'étape (1) sur la séquence d'ADN d'organite ； une étape (3) destinée à déterminer, sur la base des informations de mappage obtenues à l'étape (2), la quantité de changement dans l'expression d'ARN dans des régions individuelles ； une étape (4) destinée à sélectionner des régions dans lesquelles la quantité de changement obtenue à l'étape (3) se situe dans la plage d'une valeur de référence qui est prédéfinie ； et une étape (5) destinée à déterminer une région, parmi lesdites régions sélectionnées, qui est appropriée en tant que promoteur qui fonctionne dans un organite.本発明は、（１）ＲＮＡシーケンシング解析により得られたシーケンス情報を準備する工程、（２）工程（１）で準備されたシーケンス情報を、オルガネラＤＮＡの配列上にマッピングする工程、（３）工程（２）で得られたマッピング情報に基づき、各領域でのＲＮＡ発現の変化量を算定する工程、（４）工程（３）で得られた変化量があらかじめ設定した基準値の範囲内である領域を選別する工程、及び（５）該選別した領域のうち適切な領域をオルガネラで機能するプロモーターとして同定する工程、を含む、オルガネラで機能するプロモーターの選別方法を提供する。
