本发明属于植物基因工程领域,具体涉及miR395基因及其调控位点与应用,从水稻中克隆得到miR395基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。miR395基因的调控位点为Os03g53230,Os03g09930和Os03g09940。miR395基因及其调控位点可用于增强抗白叶枯病和细菌性条斑病的水稻品种中应用。通过miR395超量表达,发现miR395能够影响水稻抗白叶枯病和细菌性条斑病的能力。即超量表达miR395可提高水稻对白叶枯病和细菌性条斑病的抵抗能力,而超量表达miR395可以增加水稻内源的硫酸盐浓度。本发明的基因及其调控位点可用于水稻抗病育种和硫酸盐介导的抗性研究与开发。