本发明涉及的是一种基因工程技术领域的猪的猪肉质性状相关基因TRIM54的分离核酸序列,所分离核酸序列具有SEQ ID №:1所示的序列,长为748bp,以及具有SEQ ID№:4所示的序列,长为694bp。在所述的核酸序列显示了长度为18~20bp 2对等位基因特异性的核酸引物,且特异性地杂交,并扩增出含有猪TRIM54基因第二外显子、第三外显子和第二内含子的SEQ ID №:1所示序列和扩增出含有猪TRIM54基因第五内含子和第六外显子的SEQ ID №:4所示序列。本发明的实施应用可以用以检测判断猪部分肉质性状的优劣,并在猪的育种中应用该分子标记进行标记辅助选择,从而克服肉质性状必须间接选择的不足,具有重要的实际意义。