本发明公开了一种玫瑰的花青素还原酶RrANR基因及其编码蛋白和应用,玫瑰的花青素还原酶RrANR基因,其核苷酸序列为SEQ ID No.1所示,其长度为1020bp。该基因与植物原花青素合成有关。RrANR基因编码的花青素还原酶RrANR,其氨基酸序列为由SEQ ID No.2所示的氨基酸序列组成的蛋白质。本发明将玫瑰中克隆分离得到花青素还原酶基因(RrANR)导入烟草植株中,可以显著提高转基因植株中原花青素的含量,从而可以提取、分离纯化出更多的原花青素,创造出更大的经济效益有利于提高产品的附加值;并且将RrANR转化植株可以增强植物的抗逆性,为下一步培育具有高含量原花青素高抗氧化性的转基因玫瑰新品种奠定基础。