According The three-dimensional imaging system of the present invention (30), disposed on the top board (1), the patient (45) three-dimensional measuring device that generates a three-dimensional image data by shooting (4) When, from the three-dimensional image data, and generates a three-dimensional image (26) that are associated top plate (1) or the room floor (9) in the reference coordinate system based on, the three-dimensional image (26) and a three-dimensional image processing unit (6) to be displayed. Three-dimensional image processing unit (6) takes the correlation between the three-dimensional position information of the patients (45) in the reference coordinate system and the three-dimensional image data, the reference coordinate system position information of the patients (45) based on the reference coordinate system a location information extraction unit for generating (73), and a display unit for displaying a three-dimensional video (26) (72), the display unit (72), the two photographed at different timings three-dimensional video ( 26) is displayed本発明の三次元画像撮影システム(30)によれば、天板(1)に配置され、患者(45)の撮影を行って三次元映像データを生成する三次元計測器(4)と、三次元映像データから、天板(1)又は部屋の床(9)を基準とする基準座標系に関連付けされた三次元映像(26)を生成するとともに、この三次元映像(26)を表示する三次元画像処理装置(6)とを備える。三次元画像処理装置(6)は、基準座標系と三次元映像データにおける患者(45)の三次元位置情報との相関をとり、基準座標系に基づいた患者(45)の基準座標系位置情報を生成する位置情報抽出部(73)と、三次元映像(26)を表示する表示部(72)とを有し、表示部(72)は、異なるタイミングで撮影された2つの三次元映像(26)を表示する。