The present invention relates to a screening method and a diagnostic composition for treating a NANOG-dependent endometriosis cancer, and more particularly, to a method for screening a therapeutic agent by diagnosing a NANOG-dependent or anti-cancer immunostaining cancer by targeting the HDAC1-AcH3K14 / AcH3K27 molecular axis. The screening method and the composition for diagnosing an anticancer agent or an anticancer immuno-tolerant cancer using the molecular axis of the new NANOG-HDAC1-AcH3K14 / AcH3K27 molecule as a pathological marker according to the present invention are more accurate than the anticancer agent or immunotherapy- And is very useful for rapid diagnosis and development of therapeutic agents.본 발명은 NANOG 의존적 내성암 치료제의 스크리닝 방법 및 진단용 조성물에 관한 것으로, 더욱 자세하게는 HDAC1-AcH3K14/AcH3K27 분자축을 표적화하여 NANOG 의존적 항암제 또는 항암면역 내성암을 진단하고 치료제를 스크리닝하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 병리적 마커로서의 새로운 NANOG-HDAC1-AcH3K14/AcH3K27 분자축을 이용한 항암제 또는 항암면역 내성암 치료제의 스크리닝 방법 및 진단용 조성물은 항암제 또는 면역 요법 등의 항암치료에 대해 내성이 생긴 암을 보다 정확하고 신속하게 진단하고 치료제를 개발하는데 매우 유용하다.