The present invention relates to a paste composition comprising omega-3 fatty acid, egg yolk powder acting as an emulsifier, and an essential functional enhancer comprising at least one selected from D-sorbitol liquid, sodium ascorbate and enzyme-treated stevia, and sucralose acting as a solvent. The present invention also relates to a manufacturing method of the paste composition. An objective of the present invention is to provide a paste composition containing omega-3 fatty acid in which the omega-3 fatty acid is in a form of paste and can be easily ingested, and a manufacturing method of the paste composition.본 발명은 오메가-3 지방산과, 유화제로 작용하는 난황 분말과, 용매로 작용하는 D-소르비톨액 및 아스코르빈산나트륨과 효소처리스테비아 및 수크랄로스에서 선택되는 적어도 하나를 포함하는 필수 관능 개선제를 포함하는 것을 특징으로 하는 오메가-3 지방산을 포함하는 페이스트 조성물 및 이의 제조 방법에 대하여 개시한다.