PROBLEM TO BE SOLVED: To provide an optical tomographic apparatus and an image generation control method for tomographic image capable of automatically placing an image of a fundus oculi part in an optimum position to an examiner within a frame even if the width of the layer throughout the fundus oculi part is varying.SOLUTION: There is provided a control method which: analyzes a formed tomographic image of a fundus oculi part to determine the average value of depth positions of an inner boundary membrane layer within a flame and the average value of depth positions of a retinal pigment epithelial layer within the frame； and sets the difference between the average values as a value of the width of the boundary layer in a depth direction and sets a reference position as the position which is deeper than a preset offset value by the determined value of the width of the boundary layer in the depth direction； and moves a reference object such that the top edge of the retinal pigment epithelial layer is placed in the reference position, and controls to change the light path length of the reference light. The control method thus automatically places the formed tomographic image of the fundus oculi part in the optimum position in the frame regardless of the width of the layer throughout the fundus oculi part (the width from the top edge of the boundary membrane layer in the retina to the bottom edge of the boundary surface between the choroid and the sclera).【課題】眼底部全体の層の幅がさまざまな場合でも、眼底部の断層画像が検者に最適とされるフレーム内の位置に自動的に配置可能な光断層画像撮影装置及び断層画像の画像生成制御方法を提供する。【解決手段】形成された眼底部の断層画像を解析して、内境界膜層のフレーム内における深度位置の平均値と網膜色素上皮層のフレーム内における深度位置の平均値を求めて、各平均値の差を境界層の深さ方向の幅の値とし、予め設定したoffset値に対し、求めた境界層の深さ方向の幅の値だけ深い位置を基準位置とし、網膜色素上皮層の上端が上記基準位置を配置するように参照物を移動して参照光の光路長を変更するように制御することにより、眼底部の全体の層の幅（網膜における内境界膜層の上端から脈絡膜と強膜の境界面の下端までの幅）に関係なく、形成された眼底部の断層画像を自動的にフレーム内の最適位置に配置する制御方法を備える。【選択図】図７
