本发明公开了一种小麦籽粒硬度相关蛋白及其编码基因与应用。本发明所提供的小麦籽粒硬度相关蛋白,是具有下述氨基酸残基序列之一的多肽:1)序列表中的SEQID№:1;2)将序列表中SEQ ID №:1的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与小麦籽粒硬度相关的蛋白质。本发明的小麦籽粒硬度相关蛋白编码基因表达friabilin蛋白量减少,由此而导致小麦籽粒SKCS硬度提高,含有该基因的突变型小麦的籽粒硬度与野生型同品种小麦相比有较大提高,籽粒硬度达可达68。Pinb-D1r将在小麦籽粒硬度的基因工程改良和优良小麦品种的培育中起到重要作用,同时也有助于小麦籽粒硬度的遗传和分子生物学的进一步研究。