PURPOSE: A method for modifying germination of plant seed by controlling SOMNUS or functional equivalent at intracellular level is provided. CONSTITUTION: A method for modifying germination of plant seed by controlling SOMNUS or functional equivalent at intracellular level comprises a step of controlling the amount of ABA and GA by regulating the expression of gene which relates to synthesis or lysis of GA and ABA. When the expression is suppressed, the necessity for light is reduced in germination of seed.본 발명은 SOMNUS(SOM) 또는 이와 기능적 동등물의 세포내 수준을 조절하여 식물의 종자의 발아를 변화시키는 방법에 관한 것으로서 보다 상세하게는 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드 또는 상기 폴리펩티드와 적어도 60%이상의 아미노산 서열 상동성을 갖는 폴리펩티드의 세포내 수준을 조절하여 식물의 발아를 변화시키는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 SOM은 GA 및 ABA의 합성 및 분해에 관여하는 유전자의 발현을 조절하여 GA 및 ABA의 양을 조절하고, 파이토크롬 A 및 파이토크롬 B에 대한 음성 조절자 역할을 하여 발현을 억제하는 경우 종자의 발아에서 빛의 필요성을 감소시키고, 과발현시 빛의 필요성을 증가하여 보다 강한 세기의 빛을 필요로 하는 등 식물의 발아를 조절한다. 따라서, 본 발명의 SOM 또는 이와 기능적 동등물의 세포내 수준을 조절하는 경우 식물의 종자의 발아를 조절할 수 있으며, 종자의 발아가 변화된 식물 및 이의 종자를 얻을 수 있다.