本发明公开了一种提高水稻穗期稻瘟病抗性的基因及其用途。提高水稻穗期稻瘟病抗性的基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第108位碱基‑第797位碱基序列所示，编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明首次从稻瘟病持久抗性品种三黄占2号中成功克隆到提高水稻穗期稻瘟病抗性的基因，利用Camv35S启动子构建超表达Os03g0694000基因的水稻转化载体。该载体转化水稻后能大幅提高Os03g0694000基因的表达量，伴随着表达量的提高，转化植株的穗期稻瘟病抗性有明显的提高，并且转基因植株在生长状态及农艺性状上没有明显的改变。本发明超表达Os03g0694000基因的技术可以应用于水稻的基因遗传工程育种和生产实践中，提高水稻的穗期稻瘟病抗性，从而保障目前粮食短缺的情况下水稻的生产安全。
