The present invention relates to a method for operating a personalized and customized medical service to perform optimal treatment for each user by providing customized treatment control information to a medical treatment device through a network, a system thereof and a computer-readable recording medium with the method recorded therein. The method of operating a personalized and customized medical service by using at least one medical treatment device, a user terminal, and a computer system with a server computer through a network comprises the steps of: receiving user information from the medical treatment device or the user terminal; generating personalized and customized treatment control information for each user by considering the user information and treatment plan information; and transmitting the generated customized treatment control information to the medical treatment device or the user terminal.본 발명은 네트워크를 통해서 의료 시술 장치로 맞춤형 시술 제어 정보를 제공하여 사용자별 최적의 시술을 수행할 수 있는 개인화된 맞춤형 의료 서비스를 운영하는 방법과 시스템 및 이 방법을 기록한 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록 매체에 관한 것으로서, 적어도 하나의 의료 시술 장치와, 사용자 단말기 및 네트워크를 통하여 서버 컴퓨터를 구비한 컴퓨터 시스템을 이용하여 개인화된 맞춤형 의료 서비스를 운영하는 방법에 있어서, 상기 의료 시술 장치 또는 상기 사용자 단말기로부터 사용자 정보를 입력받고, 상기 사용자 정보와 시술 계획 정보를 고려하여 사용자별 개인화된 맞춤형 시술 제어 정보를 생성하고, 생성된 상기 맞춤형 시술 제어 정보를 상기 의료 시술 장치 또는 상기 사용자 단말기로 전송할 수 있다.