A method for measuring blood flow velocity from a phase contrast MRI image and a system using the same are provided. A method for measuring blood flow velocity from a phase contrast MRI image according to an embodiment of the present invention includes acquiring a single reference image which is a first image of one cardiac cycle and is an image immediately after an electrocardiogram R-wave, Obtaining a first rate encoded image and a second rate encoded image which are temporally continuous images after the image, generating a first rate image based on the reference image and the first rate encoded image, Generating an acceleration image based on the second rate encoded image, generating a second velocity image based on the first velocity image and the acceleration image, and generating a second velocity image based on at least the first velocity image and the second velocity image, And a step of measuring the temperature. According to the present invention, it is possible to measure a blood flow velocity with a higher velocity-to-noise ratio and a temporal resolution in a phase-contrast MRI imaging technique.위상 대조 자기 공명 영상으로부터 혈류 속도를 측정하는 방법 및 이를 이용하는 시스템이 제공된다. 본 발명의 일 실시예에 따른 위상 대조 자기 공명 영상으로부터 혈류 속도를 측정하기 위한 방법은, 일 심장 주기의 첫 번째 영상이며, 심전도 R-wave 직후의 영상인 단일의 레퍼런스 영상을 획득하는 단계, 레퍼런스 영상 이후의 시간 연속적인 영상인 제1 속도 부호화 영상 및 제2 속도 부호화 영상을 획득하는 단계, 레퍼런스 영상 및 제1 속도 부호화 영상을 기초로 제1 속도 영상을 생성하는 단계, 제1 속도 부호화 영상 및 제2 속도 부호화 영상을 기초로 가속도 영상을 생성하는 단계, 제1 속도 영상 및 가속도 영상을 기초로 제2 속도 영상을 생성하는 단계 및 적어도 제1 속도 영상 및 제2 속도 영상을 기초로 혈류 속도를 측정하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 한다. 본 발명에 따르면, 위상 대조 자기 공명 영상기법에서 보다 높은 속도대잡음비 및 시간해상도로 혈류 속도를 측정할 수 있는 효과가 있다.