本发明公开了一种融合蛋白及其在抗结核分枝杆菌的免疫保护中的应用。融合蛋白含有SEQ ID NO:3所示的多肽甲、SEQ ID NO:4所示的多肽乙、SEQ ID NO:5所示的多肽丙、SEQ ID NO:6所示的多肽丁、SEQ ID NO:7所示的多肽戊和SEQ ID NO:8所示的多肽己。实验证明,BCG初免后用融合蛋白加强免疫能够诱导人源化C57BL/6小鼠肝脏和肺脏中结核分枝杆菌的菌落数显著降低,其免疫保护效率优于BCG单独免疫组;在野生型C57BL/6小鼠的肝脏和肺脏中结核分枝杆菌的菌落数无显著差异。由此可见,该融合蛋白可以抑制结核分枝杆菌在人源化动物体内的增殖;据此可以制备结核分枝杆菌疫苗。本发明具有重要的应用价值。