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一种确定最佳SNP数量及其通过筛选标记对大黄鱼生产性能进行基因组选择育种的方法
- 专利权人:
- 集美大学
- 发明人:
- 王志勇,董林松,肖世俊
- 申请号：
- CN201710755157.9
- 公开号：
- CN107338321A
- 申请日:
- 2017.08.29
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2017
- 代理人:
- 姜成康
- 摘要：
- 本发明公开了一种确定最佳SNP数量及通过筛选标记对大黄鱼生产性能进行基因组选择育种的方法。先对参考群个体进行生产性能的表型测定和基因组测序，获得SNP位点；筛选出合格的SNP位点，并将缺失的基因型补齐；将参考群分为训练集和验证集进行杂交验证；通过单标记分析筛选与性状最显著关联的SNP位点，然后只使用这些位点通过GBLUP方法计算验证集个体的GEBV；进一步得到各个筛选SNP数量下的育种值估计准确度；最后确定SNP筛选的最佳数量。再根据该最佳数量，通过GBLUP方法计算出GEBV，进一步得到育种值估计准确度，根据该值的高低进行基因组选择育种。本发明可显著节省对大黄鱼生产性能的基因组选择费用。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
