本发明公开了一种植物耐热性和根发育相关蛋白及其编码基因与应用,该蛋白为蛋白质GhBRK7,蛋白质GhBRK7的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。实验证明,提高野生型拟南芥中蛋白质GhBRK7的表达量和/或活性,得到转基因拟南芥;与野生型拟南芥相比,转基因拟南芥的耐热性提高和根发育增强。抑制陆地棉TM‑1中蛋白质GhBRK7的表达量和/或活性,得到陆地棉TM‑1沉默株;与陆地棉TM‑1相比,陆地棉TM‑1沉默株的耐热性降低;耐热性降低表现为株高降低、叶片黄化、叶片中H2O2的含量增加和死亡细胞数量增加。由此可见,蛋白质GhBRK7可以调控植物的耐热性和根发育。本发明具有重要的应用价值。