本发明公开了一种柞蚕抗菌肽Cecropin及其编码基因和应用,该抗菌肽Cecropin的编码基因包括如SEQ ID NO:1所示序列的第145-273位的核苷酸序列,或者,包括如SEQ ID NO:1所示序列的第145-273位的核苷酸序列的简并序列,且所述简并序列与SEQ ID NO:1的第145-273位序列的同源性为70%以上;该抗菌肽Cecropin为具有如SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列的多肽。该柞蚕抗菌肽Cecropin及其编码基因能够应用于农业经济昆虫的细菌病防治,为一种新蛋白,为农业经济昆虫的细菌病防治提供了一种新的、负面影响小的防治途径。