In particular, there is provided a method of stabilizing a eukaryotic cell line expressing PylRS and tRNAPyl, which is suitable for incorporation of a gene encoding a target protein containing at least one unnatural amino acid encoded by a nonsense codon, wherein the tRNAPyl expression is indicative of cell viability and / Culturing the cell line under conditions such that a negative effect on growth is reduced or eliminated.특히, PylRS와 tRNAPyl을 발현하며, 넌센스 코돈에 의해 암호화된 하나 이상의 비천연 아미노산을 함유하는 표적 단백질을 암호화하는 유전자의 편입에 적합한 진핵 세포주를 안정시키는 방법으로서, tRNAPyl 발현이 세포 생존능 및/또는 세포 생장에 미치는 부정적인 영향이 감소되거나 제거되는 조건 하에서 상기 세포주를 배양하는 단계를 포함하는, 진핵 세포주를 안정시키는 방법이 제공된다.
