PROBLEM TO BE SOLVED: To provide rare-cutting endonucleases, also called custom-made meganucleases, which recognize and cleave a specific nucleotide sequence.SOLUTION: There are provided: meganuclease variants derived from an initial meganuclease presenting a recognition and cleavage site different from the site of the initial one polynucleotide encoding the meganuclease variants recombinant vector cell, animal or plant comprising the polynucleotide sequences and uses thereof for in vivo or in vitro genetic engineering and genomic engineering.COPYRIGHT: (C)2012,JPO&INPIT【課題】特異的なヌクレオチド配列を認識して切断するカスタムメイドメガヌクレアーゼともよばれるレアカットエンドヌクレアーゼを提供する。【解決手段】認識・切断部位が、由来するメガヌクレアーゼとは異なる、メガヌクレアーゼ変異型、該メガヌクレアーゼ変異型をエンコードするポリヌクレオチド、該ポリヌクレオチド配列を含む組換えベクター細胞、動物または植物、およびこれらのインビボ又はインビトロでの遺伝子工学並びにゲノム工学のための使用。【選択図】なし