PHARMACEUTICAL COMPOSITIONS FOR PREVENTING OR TREATING A MICROORGANISM INFECTION DISEASE COMPRISING A CHEMICAL COMPOUND WITH AN INHIBITORY ACTIVITY AGAINST PHOSPHOTRANSACETYLASE
KIM, EUN KI,김은기,VIVEK KUMAR MORYA,비비크,KIM, EUN KIKR,VIVEK KUMAR MORYAIN
申请号：
KR1020130078890
公开号：
KR1020150005239A
申请日:
2013.07.05
申请国别(地区):
KR
年份:
2015
代理人:
摘要：
The present invention relates to a method for identifying ligand for phosphotransacetylase of Staphylococcus aureus using a virtual screening method and to a pharmaceutical composition for preventing or treating microorganism infectious diseases comprising the ligand as an active ingredient. The in silico virtual screening method of the present invention analyzes tertiary structure of target protein, and analyzes interactions between the target protein and reference ligand using a molecular dynamics simulation method, thereby predicting activity position of the target protein using homology modeling. Based on the above facts, the present invention identifies drug-like molecules having increased bond energy for the target protein and pharmacokinetics properties through docking analysis between the target protein and lead ligand library. The present invention identifies a compound represented by chemical formula I as a Staphylococcus aureus-derived phosphotransacetylase inhibitor using the above method. Therefore, the method of the present invention can rapidly and efficiently predict large amount of physiological active candidate substances based on proteomics, bio-informatics, and combinational chemistry, thereby being able to drastically reduce new drug development costs by being applied to a new drug development field.본 발명은 가상 스크리닝 방법을 이용하여 스타필로코커스 아우레우스의 포스포트랜스아세틸라제에 대한 리간드를 동정하는 방법 및 상기 리간드를 유효성분으로 포함하는 세균 감염 질환의 예방 또는 치료용 약제학적 조성물에 관한 것이다. 본 발명의 인 실리코 가상 스크리닝 방법은 타겟 단백질의 3차 구조를 분석하고 상기 타겟 단백질과 레퍼런스 리간드 간의 상호작용을 분자동력학 시뮬레이션 방법으로 분석하여 상기 타겟 단백질의 활성 위치를 상동성 모델링으로 예측한다. 이를 토대로, 상기 타겟 단백질과 후보물질 리간드 라이브러리 간의 도킹 분석을 통해 상기 타겟 단백질에 대한 증가된 결합 에너지 및 약물동력학 특성을 가지는 약물-유사 분자들을 동정한다. 본 발명은 상술한 방법을 통해 스타필로코커스 아우레우스-유래된 포스포트랜스아세틸라제 억제제로서 화학식 I로 표시되는 화합물을 동정하였다. 따라서, 본 발명의 방법은 단백질체학, 바이오인포메틱스 및 조합화학에 기반되어 보다 빠르고 효율적으로 대량의 생리활성 후보물질들을 예측할 수 있음으로써 생명공학기술을 이용한 신약 개발 연구 분야에서 적용되어 신약 개발 비용을 획기적으로 절감시킬 수 있다.
