本发明提供了一种PagKNAT2/6b基因的应用和调控杨树株型的方法,涉及生物技术领域。PagKNAT2/6b基因为表达(a1)或(a2)的基因:(a1):含有如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列的蛋白;(a2):含有与(a1)所述的氨基酸序列90%以上同一性的氨基酸序列,且具有相同功能的蛋白。PagKNAT2/6b基因的应用包括调控杨树的分枝数目和茎柔软度,该基因在杨树中的表达量变化会影响杨树分枝的形成以及杨树茎的柔软度。该调控杨树株型的方法,包括调控杨树分枝数目和杨树茎柔软度,该方法通过调控杨树中PagKNAT2/6b基因的表达量来实现,能够更精准的改造杨树的株型,提高调控效率。