本发明公开了从毛果杨(Populus trichocarpa Torr.&Gray)中分离的花器官特异表达启动子及其应用,属于启动子的分离和应用。所述启动子的核苷酸序列为SEQ ID No.1所示。本发明还公开了含有所述花器官特异表达启动子的重组植物表达载体以及重组宿主细胞。功能验证试验发现,本发明启动子驱动的GUS基因仅在烟草萼片和花瓣中特异表达,在烟草的根、茎、叶、雄蕊和心皮等其它组织部位里没有GUS表达活性,说明本发明从毛果杨分离的启动子为花器官特异表达启动子。本发明进一步公开了所述花器官特异表达启动子在改良植物性状、培育植物新品种以及研究植物花器官的发育及调控机制等方面的应用。