本发明公开了日本血吸虫SjLwr基因的siRNA,所述siRNA为:SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列;或SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列;或SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列。本发明还公开了日本血吸虫SjLwr基因的siRNA的应用。本发明日本血吸虫SjLwr基因的siRNA,可明显抑制SjLwr基因的转录,并能显著降低血吸虫感染小鼠的虫体数、肝荷卵数、每只雌虫的肝卵贡献率和虫卵孵化率,且对虫体的体被结构和生殖腺的细胞形态也造成了一定的病理影响,适用于制备防治和治疗血吸虫病的药物。