本发明属于基因工程领域,公开了大豆拟茎点种腐病菌的检测靶标及其PCR引物组合物和应用。大豆拟茎点种腐病菌的检测靶标序列Tef,核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,该靶标序列特异性的普通PCR引物组合物,上游引物FP如SEQ ID NO.2所示,下游引物RP如SEQ ID NO.3所示。本发明的检测体系在普通PCR扩增条件下,能快速、高效、高特异、高灵敏地检测到大豆拟茎点种腐病菌,能较好满足对大豆拟茎点种腐病菌的检测,为大豆拟茎点种腐病菌的检测提供了新的技术平台,能较好满足目前对大豆拟茎点种腐病菌的检测的迫切需要,用于田间检疫、进出口检疫等的现场检测,易于大范围推广应用。