本发明公开了一套毛花猕猴桃和中华猕猴桃物种间杂交子代的鉴定引物,属于植物遗传育种领域。本引物包括3个叶绿体和3个线粒体引物对:SEQ ID NO:7/8,SEQ ID NO:9/10,SEQ ID NO:11/12,SEQ ID NO:13/14,SEQ ID NO:15/16,SEQ ID NO:17/18。本方法步骤包括:①待检测个体及亲本基因组DNA的提取;②使用上述6对引物进行PCR扩增;③PCR产物的DNA测序;④序列分析及多态位点基因型的统计;⑤杂交子代的鉴定。与现有技术相比,本发明具有操作简单、重复性好、不受环境影响等优点,可节省育种成本及加快猕猴桃育种进程。