本发明公开了一种猪源粪肠球菌及其在防治母畜各种繁殖障碍疾病方面的应用,所述猪源粪肠球菌的16SrDNA序列如SEQ ID NO:1所示,所述猪源粪肠球菌的保藏编号为CGMCC No.6977。本发明所述的猪源粪肠球菌耐热、耐酸、耐碱、耐干燥、抵抗力甚强、遗传性较稳定,无任何毒性,又能抑制常见的猪牛8种致病菌,又能提高猪精子活力并延长其寿命,改善并维持了微生态平衡。所述粪肠球菌配制成的微生态制剂能在子宫内很好生长繁殖,因而净化了母畜生殖道环境,保证了母畜正常的生理功能,从而按期发情排卵,提高受精率和产仔数,对防治母畜各种繁殖障碍疾病的应用具有重大的科学意义和很好的经济效益。