Problem to be solved: to provide a medical image processing system and a processing method capable of more accurately modeling the running state of a blood vessel.The medical image processing system comprises an image processing unit, wherein the image processing unit comprises (a) a process for identifying a three-dimensional model of an artery in a predetermined area of interest, and (b) a process for identifying a three-dimensional model of a vein in the predetermined interest area, and (c) a three-dimensional model of the artery and a three dimensional model of the veins overlap, and (d) a three-dimensional model of the artery and a three-dimensional model of the vein at the overlapAt least one of them is deformed or moved to perform a process in which the arteries and veins are not overlapped.Diagram【課題】血管の走行状態をより正確にモデル化することが可能な医療画像処理システムおよび処理方法等を提供する。【解決手段】この医療画像処理システムは、画像処理ユニットを備えるものであってその画像処理ユニットは、(a)所定の関心領域における動脈の三次元モデルを識別する処理と、(b)前記所定の関心領域における静脈の三次元モデルを識別する処理と、(c)前記動脈の三次元モデルと前記静脈の三次元モデルとが重なっている重なり部を検出する処理と、(d)前記重なり部において、前記動脈の三次元モデルおよび静脈の三次元モデルのうち少なくとも一方を変形または移動させ、動脈および静脈が重なっていない状態とする処理と、を行うように構成されている。【選択図】図3