GRAIL, INC.;PORTELA DOS SANTOS PIMENTEL, Monica;MELTON, Collin;FILIPPOVA, Darya;LARSON, Matthew, H.;MAHER, M., Cyrus;CALEF, Robert Abe Paine
发明人:
NICULA, Virgil,VALOUEV, Anton
申请号：
USUS2019/034994
公开号：
WO2019/232435A1
申请日:
2019.05.31
申请国别(地区):
US
年份:
2019
代理人:
摘要：
Classification of cancer condition, in a plurality of different cancer conditions, for a species, is provided in which, for each training subject in a plurality of training subjects, there is obtained a cancer condition and a genotypic data construct including genotypic information for the respective training subject. Genotypic constructs are formatted into corresponding vector sets comprising one or more vectors. Vector sets are provided to a network architecture including a convolutional neural network path comprising at least a first convolutional layer associated with a first filter that comprise a first set of filter weights and a scorer. Scores, corresponding to the input of vector sets into the network architecture, are obtained from the scorer. Comparison of respective scores to the corresponding cancer condition of the corresponding training subjects is used to adjust the filter weights thereby training the network architecture to classify cancer condition.L'invention concerne un système de classification de pathologies cancéreuses, dans un ensemble de différentes pathologies cancéreuses, pour une espèce donnée, dans laquelle, pour chaque sujet d'apprentissage parmi de nombreux sujets d'apprentissage, il est obtenu une pathologie cancéreuse et une construction de données génotypiques comprenant les informations génotypiques pour ledit sujet d'apprentissage. Les constructions génotypiques sont formatées sous la forme d'ensembles de vecteurs correspondants comprenant un ou plusieurs vecteurs. Les ensembles de vecteurs sont fournis à une architecture de réseau comprenant un trajet de réseau neuronal convolutif comprenant au moins une première couche convolutive associée à un premier filtre qui comprend un premier ensemble de poids de filtrage et un outil de calcul de score. Des scores correspondant à l'entrée d'ensembles de vecteurs dans l'architecture de réseau sont obtenus à partir de l'outil de calcul de score. La comparaison des scores propres à une pathol
