As for the endoscope system of this invention, one position the position correction section which sets the other position which differs and, it possesses by correcting on the basis of the other information which can obtain one position which is set in the position setting section and the position setting section which are set on the basis of one item of information which is obtained from the picture of the endoscope and the subject which possess the image pickup section which subject inside the coelom image pickup is done, one position in inside the picture, from the picture.本発明の内視鏡システムは、体腔内の被写体を撮像する撮像部を具備する内視鏡と、被写体の画像から得られる一の情報に基づき、一の位置を画像内において設定する位置設定部と、位置設定部において設定された一の位置を、画像から得られる他の情報に基づいて修正することにより、一の位置とは異なる他の位置を設定する位置修正部と、を有する。
