本发明公开了野生二粒小麦α-淀粉酶抑制因子的编码基因序列及其氨基酸序列,分别如序列表SEQ ID No.1和SEQ ID No.2或SEQ ID No.3和SEQ ID No.4或SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示,属于生物基因工程技术领域。该基因序列可以通过基因枪、农杆菌介导、花粉管通道等本领域工作人员共知的方法导入小麦,培育出抗虫性优良的小麦品种。同时依据克隆得到的基因序列,可以建立特异、便捷的分子标记体系,通过该体系进行定向育种。并且通过依据基因序列,还可以建立含α-淀粉酶抑制因子编码基因的酵母表达载体,在酵母中表达,获得α-淀粉酶抑制因子,作为植物缘杀虫剂添加到普通杀虫剂中。