普通小麦抗病序列的全基因组SSR特异分子标记及开发方法

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专利权人:

山西省农业科学院作物科学研究所

发明人:

乔麟轶,畅志坚,张晓军,常建忠,郑军,李欣,詹海仙,郭慧娟,高建刚,张文萍

申请号：

CN201510761636.2

公开号：

CN105331701A

申请日:

2015.11.11

申请国别(地区):

中国

年份:

2016

代理人:

朱源

摘要：

本发明涉及植物分子标记引物设计方法，具体为基于普通小麦抗病序列的全基因组SSR特异分子标记开发方法，解决目前现有的小麦抗病育种SSR标记存在点位多、与目的基因距离较远的问题，操作步骤为：1）、下载全基因组数据，建立本地数据库；2）、用抗病类基因家族的隐马尔可夫模型检测数据库，所得序列经筛选得包含目标抗病结构的蛋白序列，再检索本地数据库，得到相应的基因组序列片段scaffold；3）、检测每条scaffold序列中的简单重复序列位点，在SSR位点两侧设计引物，合成；4）、特异标记筛选；5）、标记多态性检测。SSR特异分子标记的核苷酸序列为：SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.78所示的序列。优点：1、位置明确、特异性强；2、与抗病候选基因距离极其紧密。

来源网站：

中国工程科技知识中心

来源网址：

http://www.ckcest.cn/home/