本发明属于基因工程领域,公开了大豆南方茎溃疡病菌的检测靶标及其特异性LAMP引物组合物和应用。大豆南方茎溃疡病菌的检测靶标序列Tef-α,核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,该靶标序列特异性的LAMP引物组合物,正向内引物FIP如SEQ ID NO.2所示,反向内引物BIP如SEQ ID NO.3所示,正向外引物F3如SEQ ID NO.4所示,反向外引物B3如SEQ ID NO.5所示。本发明的检测体系在LAMP扩增条件下,能快速、高效、高特异、高灵敏地检测到大豆南方茎溃疡病菌,用于田间检疫、进出口检疫等的现场检测,易于大范围推广应用。