Compositions and methods for use of TALENs to make genetically modified livestock or other animals are set forth. Some of the embodiments of the invention provide for making an founder animal that is completely free of all unplanned genetic modifications. Some embodiments are directed to removing genetic faults in established breeds without making other alterations to the genome. Other embodiments are directed to particular tools or processes such as a TALENs with a preferred truncation.Se establecen composiciones y métodos para el uso de TALENs para hacer ganado y otros animales genéticamente modificados. Algunas de las modalidades de la invención se proporcionan para hacer un animal progenitor que está completamente libre de todas las modificaciones genéticas no planeadas. Algunas modalidades se dirigen a remover defectos genéticos en razas establecidas sin hacer otras alteraciones al genoma. Otras modalidades se dirigen a herramientas o procesos particulares tales como TALENs con un truncamiento preferido.