本发明公开了来源于新疆野苹果的启动子及其应用。该启动子,是如下a)、b)、c)或d)的DNA分子:a)核苷酸序列是SEQ ID No.1的第9-1325位的DNA分子;b)核苷酸序列是SEQ ID No.1的DNA分子;c))与a)或b)限定的核苷酸序列具有75%或75%以上一致性,且具有启动子功能的DNA片段;d)在严格条件下与a)或b)限定的核苷酸序列杂交,且具有启动子功能的DNA片段。该启动子为组织特异和逆境诱导型启动子。利用MsDREB2C基因启动子可以使基因在特定组织器官和诱导条件下表达,因而避免了组成型启动子过量表达带来的负作用—产生大量的异源蛋白和有毒物质,为基因工程育种提供新的途径。