The present invention relates to a method and an apparatus for segmenting an anterior cruciate ligament in a knee magnetic resonance image which incorporates shape information of an anterior cruciate ligament by multi-atlas-based segmentation to prevent loss of a non-uniform area and generate a probabilistic atlas by rigid body matching-based local alignment. According to the present invention, the method for segmenting an anterior cruciate ligament in a knee magnetic resonance image comprises: (a) a step of using a probabilistic atlas generation unit to generate a probabilistic atlas of an anterior cruciate ligament by global and local alignment based on rigid body matching of multiple atlases and (b) a step of using an initial segmentation unit to segment the anterior cruciate ligament with an initial segmentation mask using the generation probabilistic atlas.COPYRIGHT KIPO 2016본 발명은 다중 아틀라스 기반 분할을 통해 전방십자인대의 형상정보를 반영하여, 불균일 영역의 손실을 막고, 강체정합 기반의 지역적 정렬을 통한 확률 아틀라스 생성할 수 있는 무릎 자기공명영상에서의 전방십자인대 분할 방법 및 장치에 관한 것으로, 본 발명에 따른 무릎 자기공명영상에서의 전방십자인대 분할 방법은 (a) 확률 아틀라스 생성부를 이용하여, 다중 아틀라스의 강체정합을 기반으로 한 전역 및 지역적 정렬을 통해 전방십자인대의 확률 아틀라스를 생성하는 단계 및 (b) 초기 분할부를 이용하여, 생성된 확률 아틀라스를 이용하여 전방십자인대를 초기 분할 마스크로 분할하는 단계를 포함하는 것을 기술적 특징으로 한다.