本发明公开了马氏珠母贝抗菌肽PmAMP及其应用,其氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示;以马氏珠母贝为研究对象,对其血清进行分离纯化,筛选出具有抑菌活性的蛋白,所获得马氏珠母贝PmAMP能明显抑制大肠杆菌和藤黄微球菌的生长,通过质谱测序,采用RACE技术克隆cDNA全长,获得编码抗菌肽PmAMP的基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3所示;应用荧光定量PCR检测PmAMP在组织中的表达含量,闭壳肌中表达含量最高,血细胞中表达含量较低,用细菌刺激之后,发现8h在血细胞中含量最高,表明PmAMP是一种免疫蛋白,本研究为马氏珠母贝的免疫研究和马氏珠母贝病害防治奠定基础。