The medical observation system includes a first position information acquiring unit that acquires first position information which is information indicating an initial position of a predetermined object on a three-dimensional image generated by using a plurality of tomographic images of the subject A movement detection unit that detects a movement of a predetermined object based on an image obtained by imaging a predetermined object existing in the subject a movement detection unit that, when a movement of a predetermined object is detected, A second position information acquiring unit that acquires second position information that is information indicating a current position of a predetermined object on the first position information and the second position information, position information that stores the first position information and the second position information in a time series A position indicating at least one of the position information stored in the position information storage section and at least the latest position information on the three dimensional image or on the pseudo perspective image generated based on the plurality of tomographic images And an information presenting unit.医療用観察システムは、被検体の複数の断層画像を用いて生成された3次元画像上の所定の対象物の初期位置を示す情報である第1の位置情報を取得する第1の位置情報取得部と、被検体内に存在する所定の対象物を撮像した画像に基づき、所定の対象物の移動を検知する移動検知部と、所定の対象物の移動が検知された際に、3次元画像上の所定の対象物の現在位置を示す情報である第2の位置情報を取得する第2の位置情報取得部と、第1の位置情報及び第2の位置情報を時系列に格納する位置情報記憶部と、位置情報記憶部に格納されている各位置情報のうちの少なくとも最新の位置情報を3次元画像上または複数の断層画像に基づいて生成された擬似透視画像上のいずれかに示す位置情報提示部と、を有する。
