本发明提供一种用于丝瓜杂交种子纯度鉴定的SSR引物及其方法，所述引物包括引物SGSSR4的上游引物SGSSR4‑F其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，和下游引物SGSSR4‑R其核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述方法步骤如下：提取丝瓜亲本以及杂种后代基因组DNA；以丝瓜基因组DNA为模板，使用引物SGSSR4进行PCR扩增；对扩增产物进行凝胶电泳；对电泳结果进行分析，只有同时具有亲本特异性条带的单株才为真正的杂交种，缺少其中的任意一条带记为假杂种，计算种子纯度，其中，引物SGSSR4能产生151bp的父本特异性条带以及135bp的母本特异性条带。本发明引物能产生父本特异性标记和母本特异性标记，特异性强；方法利用上述SSR引物，能快速、便捷、准确、有效的鉴定丝瓜杂交种子纯度。
