Disclosed are a method for divided preparation of medicine and a system for divided preparation of medicine. The method for divided preparation of medicine according to an embodiment of the present invention comprises the steps of: determining whether the number of days of prescription for medicine identified from an inputted prescription is greater than a selected reference number of days of long-term medication; determining n (n is a natural number of 2 or more) number of preparation days based on a date on which the prescription is inputted when the number of days of prescription is greater than the reference number of days of long-term medication; and performing the divided preparation of the medicine whenever the n number of preparation days have sequentially come. Therefore, the method and the system of the present invention can easily manage the side effects of the prescribed medicine through medication guidance for patients.약품 분할 조제 방법 및 약품 분할 조제 시스템이 개시된다. 본 발명의 일실시예에 따른 약품 분할 조제 방법은, 입력된 처방전으로부터 식별한 약품에 대한 처방일수가, 선정된 장기복약기준일수 이상인지 판단하는 단계와, 장기복약기준일수 이상으로 판단될 경우, 상기 처방전이 입력되는 일자를 기준으로, n(상기 n은 2 이상의 자연수)개의 조제일을 결정하는 단계, 및 상기 n개의 조제일이 순차적으로 도래할 때마다, 상기 약품을 분할하여 조제하는 단계를 포함한다.