A corneal treatment system includes an illumination system configured to deliver photoactivating light to a cross-linking agent applied to a cornea. The system includes a controller that receives input relating to a desired biomechanical change in the cornea and executes program instructions to: (i) determine, from a photochemical kinetic model, a three- dimensional distribution of cross-links for the cornea to achieve the desired biomechanical change in the cornea, where the photochemical kinetic model calculates the distribution of cross-links based on cross-linking from (A) reactions involving reactive oxygen species (ROS) including at least peroxides, superoxides, and hydroxyl radicals, and (B) reactions not involving oxygen and (ii) determine at least one set of treatment parameters to achieve the distribution of cross-links. The at least one set of treatment parameters includes illumination parameters for the delivery of the photoactivating light. The illumination system delivers the photoactivating light according to the illumination parameters.La présente invention concerne un système de traitement de la cornée comprenant un système déclairage configuré pour délivrer une lumière de photoactivation dun agent de réticulation appliqué à une cornée. Le système comprend un contrôleur recevant une entrée relative à un changement biomécanique de la cornée et exécute des instructions de programme pour : i) déterminer, à partir dun modèle cinétique photochimique, une distribution tridimensionnelle de liaisons croisées de la cornée afin dobtenir le changement biomécanique souhaité de la cornée, le modèle cinétique photochimique calculant la distribution de liaisons croisées sur la base de réactions de réticulation (A) impliquant des espèces réactives de loxygène (ROS) comprenant au moins des peroxydes, des superoxydes et des radicaux hydroxyle, et (B) des réactions nimpliquant pas doxygène et ii) déterminer au moins un ensemble de paramètres thérapeutiques pour assure