Mucus penetrating particles (MPPs) include one or more core polymers, one or more therapeutic, prophylactic and/or diagnostic agents; and one or more surface modifying agents. The surface modifying agents coat the surface of the particle in a sufficient density to enhance the diffusion of the modified nanoparticles throughout the mucosa, relative to equivalent nanoparticles that are not surface modified. Nanoparticles can be sufficiently densely coated with poly(ethylene glycol) (PEG) with a molecular weight of from 10 kD to 40 kD or greater coated with a surface density from about 0.1 to about 100 molecules/100 nm2, preferably from about 0.5 to about 50 molecules/100 nm2, more preferably from about 0.9 to about 45 molecules/100 nm2.L'invention concerne des particules pénétrant dans le mucus (MPP) contenant au moins un polymère noyau, au moins un agent thérapeutique, prophylactique et/ou diagnostique; et au moins un agent modificateur de surface. Les agents modificateurs de surface recouvrent la surface de la particule dans une densité suffisante pour améliorer la diffusion des nanoparticules modifiées à travers la muqueuse, par rapport à des nanoparticules équivalentes qui ne sont pas modifiées en surface. Les nanoparticules selon l'invention peuvent comporter un revêtement suffisamment dense de poly(éthylène glycol) (PEG) avec un poids moléculaire compris entre 10 kD et 40 kD ou supérieur, ainsi qu'une densité de surface d'environ 0,1 à environ 100 molécules/100 nm2, de préférence d'environ 0,5 à environ 50 molécules/100 nm2, idéalement d'environ 0,9 à environ 45 molécules/100 nm2.