The present invention provides a Factor IX (FIX) fusion protein comprising a heterologous moiety such as at least one XTEN. The present invention further discloses methods for producing and using the FIX fusion proteins. The present invention also provides a FIX fusion protein comprising a FIX polypeptide and an XTEN fused to the C-terminus of the FIX polypeptide and comprising an amino acid sequence that is longer than 42 amino acids and shorter than 144 amino acids. The FIX fusion proteins of the present invention have several uses, including providing methods for the prevention, treatment, amelioration, or management of coagulation diseases or conditions in patients in need thereof.本発明は、少なくとも1のXTENなどの異種部分を含む第IX因子(FIX)融合タンパク質を提供する。本発明は、上記FIX融合タンパク質の製造方法及び使用方法を更に開示する。 本発明は、FIXポリペプチドと、上記FIXポリペプチドのC末端に融合され、長さが42のアミノ酸より長く且つ144のアミノ酸より短いアミノ酸配列を含むXTENとを含むFIX融合タンパク質も提供する。本発明のFIX融合タンパク質は、それを必要とする患者における凝固疾患もしくは疾病の予防、治療、改善、または管理方法を提供することを含むいくつかの用途を有する。