The present invention relates to a universal canine influenza virus vaccine composition using HA2 helical domain of the hemagglutinin protein, which is an influenza surface protein, and to a pharmaceutical composition for preventing or treating canine influenza infection diseases. The polypeptide represented by SEQ ID NO: 3 and the polypeptide represented by residues 379-474 of SEQ ID NO: 1 of the present invention can be mass-produced from E. coli, can effectively produce neutralizing antibodies against various canine influenza subtypes, and can enhance the immune induction effect of an existing canine influenza vaccine through combinative administration, and thus can be widely utilized as universal vaccines against influenza subtypes and new type influenza mutants.본 발명은 인플루엔자 표면 단백질인 헤마글루티닌 단백질의 HA2 헬리컬 도메인을 이용한 범용성 개 인플루엔자 바이러스 백신 조성물 및 개 인플루엔자 감염 질환의 예방 또는 치료용 약학적 조성물에 관한 것이다. 본 발명의 서열번호 3으로 표시되는 폴리펩티드 및 서열번호 1의 379 내지 474 잔기로 표시되는 폴리펩티드는 대장균에서 대량 생산이 가능하고 다양한 개 인플루엔자 아형에 대하여 중화항체를 효과적으로 생산할 수 있을 뿐만 아니라 복합 투여를 통해 기존 개 인플루엔자 백신의 면역 유도 효과를 증강시킬 수 있으므로 인플루엔자 아형 및 신종 변이 인플루엔자에 대한 범용성 백신으로 널리 활용될 수 있다.