本发明涉及一种针对亚细亚镰刀菌的分子检测方法和应用,是利用对亚细亚镰刀菌的一对特异性引物对样本提取的DNA进行PCR扩增,再对扩增产物进行电泳凝胶成像分析,其中:所述的一对特异性引物为:上游引物SEQ ID NO.1和下游引物SEQ ID NO.2;对PCR扩增产物进行电泳凝胶成像分析中,根据172bp处是否出现特异条带来判断样本是否与亚细亚镰刀菌相关;所述的一对特异性引物是基于亚细亚镰刀菌相关序列扩增多态性SRAP标记,SRAP标记的序列为SEQ ID NO.3,其大小为172bp。本发明可以用于对亚细亚镰刀菌的鉴别,或用于监控亚细亚镰刀菌对农作物或饲料的污染。