本发明公开了一种植物抗盐抗病相关蛋白NtNHX1及其编码基因与应用。所述蛋白来源于本生烟草(Nicotiana benthamiana),由SEQ ID NO:1所示的536个氨基酸组成,具有调控植物抗病性、耐盐性、调节液泡H+运输、调节液泡内pH值、调节细胞还原力和/或调节细胞氧化还原池容量的功能。实验证明,将含有SEQ ID NO:2中第1321位至第1583位所示DNA分子的病毒沉默载体pTRV2-NtNHX1转化烟草得到的当代沉默植株,与转空载体对照相比,液泡H+外流明显降低;液泡内pH值降低;细胞还原力和氧化还原池容量的降低;耐盐性和抗病性能力降低。本发明在增强植物耐盐性的同时提高抗病性方面具有重要意义。