The present invention aims at evaluating the motor function of subjects with neurodegenerative diseases with higher accuracy using a motor function analysis system that utilizes the wrist joint motion of a subject. The motion function analysis system 1 of the present invention comprises a display device 3 for displaying image information including a cursor image 11 for tracking a moving target image and a target image and a display device 3 for use in moving the cursor image 11 by the subject A moving device 4, and an analysis device 7 that detects the tracking state of the target image by the cursor image and analyzes the frequency of the motion component included in the tracking situation.本発明は、被験者の手首関節運動を利用する運動機能解析システムを用いて、神経変性疾患の被験者の運動機能をより高精度で評価することを目的とする。本発明の運動機能解析システム1は、移動するターゲット画像及びターゲット画像を追跡するためのカーソル画像11を含む画像情報を表示する表示装置3と、被験者によりカーソル画像11を移動するために使用される移動装置4と、カーソル画像によるターゲット画像の追跡状況を検出すると共に、追跡状況に含まれる運動成分の周波数解析を行う解析装置7とを備える。