A method for automatic detection of a medical instrument orientation for robotic surgery is presented. In particular, this method determines the orientation of a marker device (304) attached to the medical instrument (303) in relation to the robotic system (300) by comparing movement information. In detail, the method compares the information about a movement of the marker device from a tracking system with the information about a movement of e.g. the robotic arm (301), which movement data can be acquired by the robotic system (300). One technical effect of the invention is that the orientation of the medical instrument with respect to the robotic system (300) can be determined automatically and used for subsequent calculations such as e.g. an automatic and efficient precise alignment to a target trajectory or a correct positioning assistance for e.g. a mechatronic arm. Therefore, a computer- implemented medical method of automatically determining an orientation of a medical instrument base (303) in relation to a robotic system (300) is provided.L'invention concerne une méthode de détection automatique d'une orientation d'instrument médical pour une chirurgie robotique. En particulier, cette méthode détermine l'orientation d'un dispositif marqueur (304) fixé à l'instrument médical (303) par rapport au système robotique (300) par comparaison d'informations de mouvement. En détail, la méthode compare les informations concernant un mouvement du dispositif marqueur à partir d'un système de suivi avec les informations concernant un mouvement, par exemple, du bras robotique (301), lesdites données de mouvement pouvant être acquises par le système robotique (300). Un effet technique de l'invention est que l'orientation de l'instrument médical par rapport au système robotique (300) peut être déterminée automatiquement et utilisée pour des calculs ultérieurs tels que, par exemple, un alignement précis automatique et efficace sur une trajectoire cible ou une assistance de pos