本发明涉及分子标记,具体公开了一种与番茄抗灰叶斑病基因Sm连锁的Indel标记,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明利用PCR技术对该标记进行扩增,可通过电泳检测扩增产物的片段数量和大小,判断被检番茄样品是否为抗灰叶斑病材料,进而实现对抗灰叶斑病番茄的辅助选育及快速鉴定。本发明不仅为番茄抗灰叶斑基因Sm的精细定位和分子克隆奠定了基础,同时也为利用分子标记辅助选育具有抗灰叶斑病的番茄新品种提供了高效途径。本发明基于开发的Indel标记引物提供用于辅助筛选具有灰叶斑抗性的番茄新品种的方法,可以在番茄候选材料的任何阶段对其进行灰叶斑抗性鉴定和筛选,具有高效、限制少、准确的优点。