The present invention relates to artificial molecular complexes containing at least one site-specific nuclease and directly interacting with it at least one docking domain of the repair matrix, said docking domain of the repair matrix interacting with at least one nucleic acid repair matrix sequence . An artificial complex may further comprise at least one interacting domain. Artificial molecular complexes are capable of mediating the repair of the target DNA sequence in a prokaryotic or eukaryotic organism with a high precision in a targeted manner, and thus, they can be used for genomic engineering in a prokaryotic or eukaryotic cell or organism or for editing the viral genome. Also provided are methods of modifying at least one target DNA sequence in a prokaryotic or eukaryotic cell or in the viral genome, for example, to develop a trait or to treat a disease. In addition, a method of manufacturing a plant, plant cell, plant material or derivative, or its offspring, containing or edited at least one artificial molecular complex.Настоящее изобретение относится к искусственным молекулярным комплексам, содержащим по меньшей мере одну сайт-специфичную нуклеазу и непосредственно взаимодействующий с ней по меньшей мере один стыковочный домен матрицы для репарации, причем указанный стыковочный домен матрицы для репарации взаимодействует по меньшей мере с одной репарационной матричной последовательностью нуклеиновой кислоты. Искусственный комплекс может дополнительно содержать по меньшей мере один взаимодействующий домен. Искусственные молекулярные комплексы выполнены с возможностью опосредования репарации последовательности ДНК-мишени в прокариотическом или эукариотическом организме с высокой точностью целенаправленным образом, и, таким образом, они могут быть использованы для геномной инженерии в прокариотической или эукариотической клетке или организме или для редактирования вирусного генома. Также предложены способы модификации по меньшей мере одной последовательност