PROBLEM TO BE SOLVED: To align two images captured at different time points with higher accuracy and lower calculation cost. An image processing apparatus disclosed in the present specification includes an acquisition unit that acquires a first image and a second image of a subject imaged at different times, and an object extracted in the first image. A first distance image having a pixel value based on the distance from the contour of the region showing the predetermined part of the specimen and having a lower resolution than the first image is generated and extracted in the second image. A generating unit that generates a second distance image having a pixel value based on the distance from the contour of the region indicating the predetermined portion and having a lower resolution than the second image； and the first distance image. A first calculator that calculates first deformation information by aligning the second distance image, and aligns the first image and the second image based on the first deformation information. And a second calculation unit that calculates the second deformation information by performing the above. [Selection diagram]【課題】 異なる時点で撮像された２つの画像をより高い精度、且つより低い計算コストで位置合わせする。【解決手段】 本明細書に開示の画像処理装置は、被検体を互いに異なる時刻に撮像した第１の画像と第２の画像を取得する取得部と、前記第１の画像において抽出される被検体の所定の部位を示す領域の輪郭からの距離に基づいた画素値を有し、且つ前記第１の画像より解像度が低い第１の距離画像を生成し、前記第２の画像において抽出される前記所定の部位を示す領域の輪郭からの距離に基づいた画素値を有し、且つ前記第２の画像より解像度が低い第２の距離画像を生成する生成部と、前記第１の距離画像と前記第２の距離画像を位置合わせすることにより第１の変形情報を算出する第１の算出部と、前記第１の変形情報に基づいて前記第１の画像と前記第２の画像を位置合わせすることにより第２の変形情報を算出する第２の算出部と、を備えることを特徴とする。【選択図】 図１
